Když se objeví nová nemoc, vědci z celého světa přijmou opatření, aby zjistili, co s tím mohou dělat, a doufají, že najdou nové způsoby, jak pomoci.
Vědci z University of Minnesota (UM) to udělali – zkoumáním struktury proteinu „spike“ na povrchu SARS-CoV-2 tým doufá, že přispěly k základu pro vývoj nového léku.
„Obecně platí, že studiem, které strukturální rysy virových proteinů jsou nejdůležitější pro navázání kontaktu s lidskými buňkami,“ vysvětluje biomedicínský výzkumník Fang Li, „můžeme vyvinout léky, které je vyhledají a zablokují jejich aktivitu.“
Tým použil rentgenovou krystalografii k vytvoření 3D modelu toho, jak špičatý protein vypadá a jak se váže na lidské buňky.
I když to nezní jako fotografie koronaviru, které jste zvyklí vidět, je to neuvěřitelně užitečný model pro biology. Umožňuje jim vizualizovat, jak malé mutace v proteinu vytvářejí různé záhyby a hřebeny, které virová částice používá k připojení k receptorům v našich vlastních buňkách.
Vědci zjistili, že kmen koronaviru SARS-CoV-2 má několik mutací, které tvoří zvláště kompaktní „hřeben“ v proteinu špice.
Tento hřeben je kompaktnější než virus SARS a může být jedním z důvodů, proč je tento nový kmen natolik zběhlý v infikování lidí, že způsobuje COVID-19.
„3D struktura ukazuje, že ve srovnání s virem, který způsobil vypuknutí SARS v letech 2002-2003. Nový koronavirus vyvinul nové strategie pro vazbu na svůj lidský receptor, což vede k těsné vazbě, “řekl Lee.
„Pevná vazba na lidský receptor může pomoci viru infikovat lidské buňky a šířit se mezi lidmi.“
Tým doufá, že nová simulace pomůže dalším vědcům vyvinout léky nebo vakcíny proti viru.
“Naše práce by mohla pomoci vyvinout monoklonální protilátky, které působí jako lék k rozpoznání a neutralizaci receptorové vazebné části špičkového proteinu,” řekl Lee.
„Nebo by některý z trnových proteinů mohl být základem vakcíny.“
V této fázi však musíme být opatrní. Tento druh výzkumu se neustále vyvíjí, a přestože je model slibný, studie používala pouze malé fragmenty viru – jeho vazebné domény – a proto zbývá studovat více informací.
Studie byla publikována v časopise Nature.
Zdroje: Foto: (Shang et al., Nature, 2020)
