Možná jste slyšeli o aplikaci Folding @ home, populární aplikaci, kterou lze spustit na počítači a která pomáhá vědcům vyrovnat se s některými zdravotními problémy, včetně nového koronaviru.
Za poslední měsíc se síť dobrovolníků, kteří ji nainstalovali, rozrostla natolik, že platforma předčí nejvýkonnější superpočítače na světě.
Podle ředitele Folding @ home a biochemika Grega Bowmana se v posledních týdnech připojilo téměř 700 000 nových operátorů Folding @ home. To je obrovský nárůst oproti 30 000 lidem, kteří neustále používají Folding @ home po celou dobu.
A také to znamená obrovský rozdíl ve výpočetním výkonu – síť Folding @ home dosáhla počátkem tohoto týdne neuvěřitelných 2,4 exaflops výpočetního výkonu, což je rychlejší než u 500 nejlepších světových superpočítačů dohromady.
Hlavním úkolem aplikace Folding @ home je modelovat chování proteinů v těle, které je základem mnoha základních biologických funkcí.
Mezi tyto funkce patří virová infekce: tým Folding @ home zkoumá zejména to, jak se takzvaný „hrot“ viru SARS-CoV-2 (který je ve skutečnosti tvořen třemi proteiny) váže na lidské buňky a infikuje lidské tělo.
Toto je klíčový způsob vstupu nového koronaviru do lidské tkáně, takže jeho blokování by mohlo být pro budoucí léčbu a očkování zásadní. Pokud dokážeme pochopit, jak fungují proteiny spike – což jsou počítačové simulace společnosti Folding @ home -, můžeme lépe vyvíjet léky, které je zastaví.
Špička proteinu SARS-CoV-2 v akci. (Folding @ home / YouTube)
„Pokud byste se pokusili simulovat takový proces na svém domácím počítači, měli byste to štěstí, že byste během příštích 100 let viděli co i jen část procesu,“ píše Bowman na blogu Folding @ home. “Naštěstí máme posily!”
Kouzlo aplikace Folding @ home spočívá v tom, že rozkládá složité počítačové simulace chování bílkovin na menší úkoly, které lze poté distribuovat na tisíce počítačů po celém světě – každý z nich kousek.
Folding @ home také provádí mnoho dalších projektů souvisejících s koronavirem: zpracovává data za účelem vyhodnocení účinnosti potenciálních léků, které jsou nyní testovány v laboratořích, a za účelem analýzy toho, jak koronavirus řídí buněčný mechanismus po infekci.
